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内容简介:
《第二代测序信息处理》几乎涵盖了 NGS技术在生命科学领域的应用,包括从头测序 (含基因组注释)、针对稀有变异检测和元基因组研 究的扩增子测序、染色 质免疫共沉淀测序(ChIP—seq)、RNA测序(RNA— seq)和肿瘤体细胞变异 检测(包括单碱基替换、插入、缺失和易位)等。通 过广泛使用的一线软 件充分讨论数据分析方法,详述优工作流程(包括 部分学习指南),实用 性强、可靠性强、专业指导性强。
本书非常适用于从事生命科学研究的研究生和青 年学者。他们不仅可 以在这里了解到不同软件的详细使用方法和参数设置 ,还可以在作者提供 的软件评估和优化流程的基础上找到自身研究项目所 需的第二代测序信息 处理的很好解决方案。
书籍目录:
《新生物学丛书》丛书序
译者前言
前言
1 DNA测序简介
2 测序信息学的历史
3 第二代测序数据的可视化
4 DNA序列比对
5 用广义de Bruijn有向图算法组装基因组
6 用短序列读段从头组装细菌基因组
7 基因组注释
8 使用第二代测序技术检测序列变异
9 ChIP—seq
10 使用第二代测序进行RNA测序
11 元基因组学
12 DNA测序信息学中的高性能计算
术语表
索引
彩图
作者介绍:
Stuart M.Brown是纽约大学医学院细胞生物学系助理教授、卫生信息学和生物信息学中心高级教职人员,同时是生物信息学咨询小组营运总监,也是序列信息学小组组长。他在纽约大学教授了12年生物信息学研究生课程,是生物信息学和医学基因组学教材的作者。Brown博士在康奈尔大学获得分子生物学博士学位。
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编辑推荐
在本书中,作者以三十多个国立卫生研究院(National Institutes of Health, NIH)资助项目的大量经验为基础,综合本领域著作并去粗取精,为读者提供了多种新一代测序研究的展示
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书籍真实打分
故事情节:4分
人物塑造:5分
主题深度:3分
文字风格:9分
语言运用:3分
文笔流畅:9分
思想传递:5分
知识深度:5分
知识广度:7分
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章节划分:5分
结构布局:5分
新颖与独特:6分
情感共鸣:7分
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沉浸感:3分
事实准确性:6分
文化贡献:8分